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陈彬彬,叶威,黄约诺,方涛,林雪娇,董晓亭.基于TCGA 数据库的肺腺癌自噬基因预后模型的建立与应用[J].浙江中西医结合杂志,2022,32(4):
基于TCGA 数据库的肺腺癌自噬基因预后模型的建立与应用
投稿时间:2021-09-03
修订日期:2022-03-16
DOI:
中文关键词
:
肺腺癌
自噬基因
TCGA 数据库
预后
英文关键词
:
基金项目
:
作者
单位
E-mail
陈彬彬
温州市中医院
452900804@qq.com
叶威
*
温州中医院
417119035@qq.com
黄约诺
zhejiang chinese medical university
方涛
zhejiang chinese medical university
林雪娇
zhejiang chinese medical university
董晓亭
zhejiang chinese medical university
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12
中文摘要
:
摘要 :目的 利用 TCGA 数据库建立预测肺腺癌预后的自噬相关基因预后模型。 方法 通过 R 语言软件筛选出 TCGA 数据库中肺腺癌样本及癌旁样本中差异表达的自噬基因,探讨其潜在功能。R(v 3.6.1)筛选预后相关的自噬基因(ATG),计算各样本的风险值(RS)并构建预后模型,进一步探讨RS与生存关系。同时验证ATG与对临床信息的相关性。结果 共筛选出 9个表达差异ATG(RAC1、SQSTM1、CD46、NRG3、IKBKB、VMP1、WIPI1、FKBP1B、IKBKB)。Kaplan-Meier 生存分析证实,高RS的LUAD患者总体生存率明显缩短 (p<0.05)。Cox 回归分析显示RS是肺腺癌患者独立预后因素(p<0.05)。结论 RS可用于预测肺腺癌细胞癌患者的预后,有利于进一步指导临床治疗。
英文摘要
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