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陈彬彬,叶威,黄约诺,方涛,林雪娇,董晓亭.基于TCGA 数据库的肺腺癌自噬基因预后模型的建立与应用[J].浙江中西医结合杂志,2022,32(4):
基于TCGA 数据库的肺腺癌自噬基因预后模型的建立与应用
投稿时间:2021-09-03  修订日期:2022-03-16
DOI:
中文关键词:  肺腺癌  自噬基因  TCGA 数据库  预后
英文关键词:
基金项目:
作者单位E-mail
陈彬彬 温州市中医院 452900804@qq.com 
叶威* 温州中医院 417119035@qq.com 
黄约诺 zhejiang chinese medical university  
方涛 zhejiang chinese medical university  
林雪娇 zhejiang chinese medical university  
董晓亭 zhejiang chinese medical university  
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中文摘要:
      摘要 :目的 利用 TCGA 数据库建立预测肺腺癌预后的自噬相关基因预后模型。 方法 通过 R 语言软件筛选出 TCGA 数据库中肺腺癌样本及癌旁样本中差异表达的自噬基因,探讨其潜在功能。R(v 3.6.1)筛选预后相关的自噬基因(ATG),计算各样本的风险值(RS)并构建预后模型,进一步探讨RS与生存关系。同时验证ATG与对临床信息的相关性。结果 共筛选出 9个表达差异ATG(RAC1、SQSTM1、CD46、NRG3、IKBKB、VMP1、WIPI1、FKBP1B、IKBKB)。Kaplan-Meier 生存分析证实,高RS的LUAD患者总体生存率明显缩短 (p<0.05)。Cox 回归分析显示RS是肺腺癌患者独立预后因素(p<0.05)。结论 RS可用于预测肺腺癌细胞癌患者的预后,有利于进一步指导临床治疗。
英文摘要:
      
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