| 陈松鹤,王燕,龚雯婷,陈烨,虞听.基于GEO数据库及网络药理学初探扶正化瘀胶囊抗肝纤维化的作用机制[J].浙江中西医结合杂志,2023,33(6): |
| 基于GEO数据库及网络药理学初探扶正化瘀胶囊抗肝纤维化的作用机制 |
| Preliminary study on the mechanism of Fuzheng Huayu capsule in anti-hepatic fibrosis based on GEO database and network pharmacology |
| 投稿时间：2022-03-06 修订日期：2022-07-27 |
| DOI： |
| 中文关键词: GEO数据库 差异基因 网络药理学 分子对接 扶正化瘀胶囊 肝纤维化 机制初探 |
| 英文关键词: |
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| 中文摘要: |
| 目的：运用GEO数据库联合网络药理学及分子对接验证的方法以初探扶正化瘀胶囊抗肝纤维化潜在作用机制。方法：运用GEO数据库筛选出疾病差异基因，从TCMSP筛选出扶正化瘀胶囊有效成分与靶点并进行标准化处理；利用Cytoscape3.9.0构建“中药-成分-靶点”调控网络；通过STRING数据库构建蛋白互作网络，并筛选出核心靶点；利用药物疾病共同靶点进行GO和KEGG富集分析，利用核心靶点蛋白受体与对应成分的小分子配体进行分子对接验证。结果：GEO数据库筛选出疾病差异基因8478个，TCMSP筛选出扶正化瘀胶囊有效成分126种，靶基因1261个。“中药-成分-靶点”可视化展示共135个节点，262条边，通过节度值分析参与调控的主要成分有槲皮素、木犀草素、山柰酚、丹参酮IIA等；PPI网络得出MMP9、CASP3、IL1B、CCL2等核心靶点9个。GO功能富集结果显示生物过程可能与对异物刺激、活性氧及代谢过程等反应有关；细胞成分可能与细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶全酶复合物，蛋白激酶复合物等有关；分子功能可能与类固醇激素受体活性，核受体活性，配体激活的转录因子活性等有关。KEGG富集分析结果共涉及36条通路，靠前最可能与AGE-RAGE信号通路在糖尿病并发症中的作用，TNF信号通路，IL-17信号通路，NF-κB信号通路等有关。选取核心靶点蛋白MMP9、CASP3、CCL2和IL1B与对应的有效成分槲皮素小分子配体进行分子对接验证，结果显示均具有较好的结合活性和稳定的结合构象。结论:扶正化瘀胶囊通过多靶点、多途径、多通路发挥抗肝纤维化的作用，为进一步深入研究其抗纤维化相关机制提供参考。 |
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